Ekrem Cunedioğlu, TOBB Ekonomi ve Teknoloji Üniversitesi Ekonomi Bölümü'nden mezundur. Cunedioğlu, 2008 yılında TEPAV'a katılmış ve 2013 yılına kadar araştırma görevlisi olarak görev yapmıştır. Ardından 2013-2018 yılları arasında Özyeğin Üniversitesi ve İskenderun Teknik Üniversitesi'nde akademik çalışmalarını sürdürmüştür. Bu süreçte 2015 yılında kendi danışmanlık şirketini kuran Cunedioğlu, 2018 yılında PwC Devlet ve Kamu Sektörü danışmanlık ekibine 2020 yılına kadar yönetici olarak katılmış ve ardından 2021 yılına kadar Türkiye İşveren Sendikaları Konfederasyonu'nda (TİSK) da yönetici olarak çalışmıştır.

Daha sonra, 2023 yılının ortalarına kadar Cunedioğlu, çeşitli politika alanlarını kapsayan çok sayıda projede çeşitli yerel ve uluslararası kuruluşlara danışmanlık hizmeti vermiştir. Cunedioğlu, özellikle projeler için analitik çerçevelerin tasarlanması ve analiz süreçlerinin yürütülmesi konusunda uzmanlaşmıştır. Buna ek olarak, Cunedioğlu istihdam, sanayi ve ticaret politikaları üzerine çeşitli makaleler yayımlamıştır.

Ekrem Cunedioğlu, Temmuz 2023'te Kalkınma Programı Direktörü olarak TEPAV'a katılmıştır.