Yakup Peker, Orta Doğu Teknik Üniversitesi İktisat Bölümü‘nde lisans  ve İstatistik Bölümü‘nde yandal programını 2011 yılında yüksek şeref derecesi ile tamamladı.

Aynı yıl Zafer Kalkınma Ajansı’nda uzman olarak çalışmaya başladı. Ağırlıklı olarak bölgesel ve yerel ölçekli araştırma ve analiz çalışmalarında bulunan Peker, TR33 Bölgesi 2014-2023 Bölge Planı hazırlık sürecinde Plan Koordinatör Yardımcısı olarak görev yaptı.

2015 yılının Ocak ayında TEPAV’a katılan Yakup Peker, yerelde ekonomik büyüme/kalkınma stratejileri ve rekabet gücü gündemleri üzerine çalıyor. Peker’in ilgi alanları arasındaysa bölgesel kalkınma, yerelleşme, sanayi politikaları ve stratejik planlama bulunuyor.

Yakup Peker, Ocak 2015 - Aralık 2022 yılları arasında TEPAV'da Proje Yöneticisi olarak görev almıştır.